自1958年秋，木渎镇从苏州市郊区划归吴县，将设在木渎镇上的苏州市寄生虫防治站改为吴县第二人民医院筹备处，1959年7月18日定名为吴县木渎人民医院，1966年11月与吴县血吸虫病防治站合并为吴县人民医院，1969年8月改名为吴县人民卫生防治院，1970年改名木渎镇革命委员会卫生队。1971年7月20日改名吴县木渎人民医院（县级医院），1984年5月改名为吴县人民医院，1995年10月更名为吴县市第二人民医院，1995年6月医院和吴县市中医院实行一套班子领导，1998年6月二院正式合并，院名为吴县市第二人民医院、吴县市中医医院，2001年7月更名为苏州市木渎人民医院、吴中中医院。

全院正式职工445人，其中卫技人员363名，行政后勤82名，高级职称19名，中级职称119名，初级职称225名。

全院设临床科室32个，医院蛇伤科是苏州市重点专科，感染科是吴中区定点单位，骨科、脑外科、妇产科、ICU是医院重点专科。床位290张。2004年门急诊人数：206389人次，住院病人数：10174人次，手术人数：3115人次，床位使用率99.4%。

医院大型医疗设备有：螺旋CT、彩色B超、500MA多功能遥控X光机、C型臂X线机、全息动态心电监护系统、全自动血球仪、酶标仪、全自动血气分析仪、全自动免疫分析仪、血球计数仪、电子胃镜、电子肠镜、拉斐尔呼吸机、震波碎石机、高压氧舱、CR计算机放射成像系统、血液透析仪、重症监护系统、微生物培养、鉴定、药敏分析系统等。核磁共振仪在采购中。医疗设备总值达2463万元。

医院挂号、收费、药品、财务实行计算机管理。为苏州市、吴中区医保定点单位。

全院占地面积：31982M2，业务用房25821M2，辅房7975M2，住宅房8711M2。

新建门、急诊楼即将开工建设。