木兰溪防洪堤工程主要是起防冲、防塌作用的堤岸。在中华人民共和国成立前，局部地段已有用卵石砌成高2米的溪堤，但经常被洪水冲塌，淹没农田。中华人民共和国成立后，县人民政府组织群众有计划按标准在木兰溪两岸修筑堤岸。1966年，成立木兰溪治理工程指挥部，晋江地区和县财政拨款100万元，沿溪流所在公社、大队也自筹资金数百万元，从度尾后埔至盖尾仙潭全线50余公里的木兰溪两岸开展全民筑堤活动。由度尾、大济、龙华、城关、赖店、榜头、盖尾等7个公社和城关镇，共48个大队(街)，每天上场1万多民工，经过一年多奋战，投工170万工日，完成土石方250万立方米，使木兰溪两岸60～70%都筑上一道10年一遇防洪标准的石堤，堤线顺直，河槽宽度按流量段布置，拆除阻碍溪水畅通的和影响对岸堤防安全的斜堤、丁坝、乌龟(水下石砌体)，对个别过于弯曲的河道截弯取直。此后，每年都从农业水利经费及防汛保险经费中拨出部分款项，维修和修复水域堤岸，并新建少量堤岸。