马同勋，1916年出生于河南孟津县，幼时未进小学，读了7年私塾。故而四书五经、历代古文背诵如流，国学基础较厚。1933年，考入省立安阳高中，1936年，河南全省高中毕业会考，名列第一。随後考入武汉大学历史系。在此期间，曾与同好奔赴河南、山西抗战前线，创办《行都日报》，穿梭於黄河两岸，进行战地报导，直到1939年被查封，才返回武大继续学业。1941年，大学三年级时，在全国大学生三优竞赛中获当时教育部颁发的学业、操行、体育三优奖状（全校仅3名），奠定了从事学术研究的基础。1942年毕业，毕业论文为近8万字的《明代倭寇考》，并以优异成绩留校任文学院助教，次年即正式开课，讲授法学院的《中国通史》。由于教学效果好，1946年晋升为讲师，短短4年时间，由助教升为讲师者，在当时的武大是空前的。接着又讲授《中国政治制度史》、《中国文化史》、《中国近代史》等专业课程。在此期间，又任训导处学生指导组主任等职，并积极参加抗日和反国民党专制活动，掩护进步学生。亦因此而於1951年3月6日遭人陷害入狱，在狱中经历了13年的囹圄生涯，浪费了宝贵的学术生命。文革期间，在武汉监狱教育科工作。直到1986年全面平反。

马先生在武汉大学几十年来，除授课外，主要研究隋唐史、明清史、中国近代史、中国政治制度史以及方志学等。出版的专著先后有《明代倭寇与海防考》、《太平天国军事制度》、《美帝侵华简史》、《隋唐两京考》（协助杨鸿年先生，武汉大学出版社，2005年），并参加编写出版《湖北省道教志》、《湖北现代监狱》等著作。退休后，仍老有所为，继续编写《明代赋税制度》，并参加武大三至九世纪研究所关于《全唐文》（共1000卷）职官与社会经济问题的研究，参编《全唐文职官丛考》（陈国灿、刘健明主编，武汉大学出版社，1997年）。 马先生治学受吴其昌影响，吴先生生前教导他，治学有三贵：贵博、贵精、贵通。他遵照这个教导，奉行数十载，虽历经磨难而奋斗不辍。之所以稍有成就者在此。

关於马先生的一生，可参考皮公亮的访谈：《坎坷磨难志弥坚——访武大马同勋教授》。