20世纪50年代初，美国康奈尔大学学者Henderson提出了BLUP法，即最佳线性无偏预测(Best Linear Unbiased Prediction)法，该方法能显著提高遗传进展，特别是对于低遗传力性状和限性性状，其效果更加明显。70年代以来这一方法在牛的遗传改良中得到了广泛应用，成为多数国家牛育种值估计的常规方法。80年代后期，一些国家开始把这一方法应用于猪。

BLUP法具有估计值无偏、估计值方差最小、可消除因选择和淘汰等原因造成的偏差等特性，获得的个体育种值具有最佳线性无偏性，是当今世界范围内主要的种畜遗传评定方法。

最佳: 估计误差最小; 估计与真实育种值相关最大

线性: 估计是基于线性模型; 假设个体性能是遗传和非遗传效应的总和

无偏: 估计过程中估计值是无偏的; 估计与真实育种值间平均差为零, 即所有可能估计值的平均值等于真实育种值.

预测: 一个体将来作为亲本的预测育种值