江苏正大天晴药物研究院有南京和连云港两个药物研发中心，南京研发中心坐落在南京市紫金山东麓的徐庄软件产业基地内。南京徐庄软件产业基地位于南京主城区发展的核心区域，毗邻国家5A级旅游风景区——钟山风景名胜区，沪宁高速、宁连高速、机场高速、312国道（即玄武大道）交汇于此，交通发达，地理位置优越，具有浓厚的科研氛围。

南京研发中心总投资2亿元，建筑面积约2万平方米，在国内医药企业中，建设规模位居前列。连云港研发中心建筑面积约1万平方米，坐落在美丽的海滨旅游城市――连云港市，承担着科研开发、工艺交接等大量重要的科研任务。

研究院目前拥有科研人员130余名，其中高级工程师8名，博士5名，硕士32名，平均年龄仅仅30岁。设有化学部、制剂部、中药部、分析部、博士后工作站、医学事务部等内部机构，可以承担原料工艺研究、制剂工艺研究、质量标准研究等药学研究课题，同时还能开展多种领域的药理学、毒理学研究课题，并可以自主进行临床研究。 2006年起，开始涉足生物工程药物的开发，现已初见成效。

正大天晴的研究领域涉及肝病、肿瘤、糖尿病、呼吸、心脑血管、抗感染、消化、神经等八大疾病领域。特别是在肝病药物研究领域具备独特的优势，拥有保肝降酶药、抗病毒药物、免疫调节药；还开发了抗肝纤维化药物、肝性脑病药物、脂肪肝药物、肝病辅助治疗贴剂、护肝保健品等一系列产品。