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词条 简型外膜蛋白质生物信息学
释义

图书信息

作 者:孟朝晖著丛 书 名:

出 版 社:国防工业出版社

ISBN:9787118050349

出版时间:2007-04-01

版 次:1

页 数:276

装 帧:平装

开 本:

所属分类:图书 > 科学与自然 > 生物科学

内容简介

筒型外膜蛋白质是广泛存在于革兰氏阴性菌、线粒体和叶绿体外膜的结构类似筒型的蛋白质,研究这种蛋白质的结构和功能对于了解细胞内物质和能量的运作机理十分重要。本书用生物信息学的方法研究筒型外膜蛋白质,详细介绍了筒型外膜蛋白质的基本结构和功能,包含结构模型、角度模型、侧链旋转异构体等,对目前已知三维结构的筒型外膜蛋白质分为10种类型详细介绍,还研究了筒型蛋白质OmpA的折叠过程。分别用神经网络模型、隐马氏模型及根据蛋白质的物理化学特性抽象出的几种结构辨识模型,分析了蛋白质的结构。为了方便不同学科的读者能够较为顺利地阅读本书,其中涉及到的相关基础知识均有适当介绍,包括蛋白质基础知识和蛋白质数据库PDB 的相关内容,神经网络模型和隐马氏模型的基本内容也有简明阐述。

目录

第1章 蛋白质简介

1.1 氨基酸

1.2 肽链

1.3 肽键的空间结构与β-折叠

第2章 蛋白质数据库PDB

2.1 PDB数据格式

2.2 序列和原子坐标记录

2.3 蛋白质二级结构数据

2.4 注释记录

2.5 连接类记录

第3章 β-筒型外膜蛋白质

3.1 β-筒型外膜蛋白质的结构

3.2 良筒型外膜蛋白质的功能

3.3 β-折叠股的N端和C端不对称

3.4 角度模型

3.5 侧链旋转异构体

第4章 β-筒型外膜蛋白质的数据

4.1 OMPA超族

4.2 OMP超族

4.3 Autotransporter超族

4.4 OMPLA超族

4.5 Tsx超族

4.6 长链脂肪酸转运蛋白族

4.7 寡糖转运蛋白族

4.8 孔蛋白族

4.9 麦芽糖孔蛋白族

4.10 配体门控通道蛋白族

4.11 附录

第5章 β-筒型外膜蛋白质的折叠

5.1 OmpA的SDS-OG-DMPC折叠过程

5.2 OmpA的UREA-DMPC折叠过程

5.3 OmpA折叠的3个中间过程

……

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更新时间:2025/3/1 13:56:51