济宁医学院精神卫生学院成立于1994年，设有临床医学专业（精神病学与精神卫生方向）和应用心理学两个专业。临床医学专业（精神病学与精神卫生方向）创建于1987年，原为精神医学专业，1989年招收第一届本科生，1998年教育部进行专业目录调整，改为现名，为目前国内办学最早、招生规模最大的精神医学专业之一。2004年增设四年制应用心理学本科专业，文理兼收。

学院现设有6个教研室和1个实验室，亚洲地区唯一的行为医学学术期刊，我国第一份以“脑科学”命名的国家级学术期刊《中华行为医学与脑科学杂志》设在院内，中华医学会行为医学分会、山东省行为医学专业委员会均挂靠学院，拥有国内行为医学专业唯一省级重点实验室“山东省行为医学重点实验室”和省级人文社科基地“山东省行为与健康研究基地”、 “山东省行为医学教育研究所”、“精神卫生研究所”、“心理学研究所”、“行为医学研究所”六个研究机构。

目前，学院有专任教师16人，全部为硕士以上学历，其中博士3人，高级职称6人，学校中青年学术骨干学科带头人培养对象4人，教学名师2人，拥有“精神医学专业”、“行为医学”、“医学心理学”三支优秀教学团队，精神医学主要专业课程使用全英文教材，在国内同类专业院校中率先实施双语教学。

近年来，共承担“十一五”国家科技支撑计划、“十五”攻关课题、863、纽约CMBA、山东省自然科学基金、山东省教育厅、山东省卫生厅等多项科研项目，其中成果鉴定国际领先1项，国内领先6项；主（副）编国家级规划教材5部，出版专著30余部，发表论文200余篇；获省级优秀教学成果奖2项，厅局级以上科技奖励11项。

先后有英国、日本、美国等7个国家的专家学者和官员来院讲学、参观访问。积极组织参加社会公益活动，先后派出6名专家教授赶赴四川地震灾区参与灾后心理干预和社区重建工作。2008年，临床医学专业（精神病学与精神卫生方向）被评为山东省特色专业，2010年，应用心理学专业被评为校级特色专业；课程建设卓有成效：2011年，《精神病学基础》被评为山东省双语教学示范课程；《精神病和精神卫生学》为校级重点学科，《精神病学》为校级精品课程，《精神药理学》、《临床精神病学》、《精神病学基础》为校级优质课程。