集美大学海洋动物馆建于1983年，占地面积1000多平方米，座落于我国著名的文化风景旅游区陈嘉庚先生的故乡——集美学村。目前馆藏海洋生物近2000种，其中鱼类1100多种，软体动物近300种，甲壳动物250多种，腔肠动物150多种，其它海洋生物200多种，并饲养热带观赏性鱼类40多种；分为鲸豚馆、水族馆、海洋无脊椎动物馆、鱼类馆四部分。该馆海洋生物主要采自西沙群岛、海南岛海域及闽南渔场，反映了印度—西太平洋海区热带、亚热带海洋动物区系的特征。可谓集我国热带、亚热带海洋生物之大全，融观赏性、科学性、知识性、趣味性于一体，并具有多、奇、珍等特点。

一、鲸豚馆：该馆陈列的国家二级保护动物抹香鲸，长12.5米，重达25吨；还有国家一级保护动物——中华白海豚，中华鲟；二级保护动物——伪虎鲸、宽吻海豚、海龟、玳瑁等。

二、水族馆：饲养40多种体色艳丽、体态婀娜多姿、异彩纷呈，具有很高观赏价值的热带观赏性鱼类。有“活化石鱼”之称的银龙，形象栩栩如生的魔鬼刀、地图鱼、七星飞刀鱼、红绿灯、非洲凤凰，还有一生中能性别转换的剑尾鱼等。

三、海洋无脊椎动物馆：保存有采自西沙群岛的珊瑚、贝类等，包括国家二级保护动物——红珊瑚、星状扁脑珊瑚、佳丽鹿角珊瑚、笙珊瑚、菊花珊瑚、刺星珊瑚等。有国家二级保护动物——虎斑宝贝，噬人致死的芋螺、以及各式各样的宝贝、笋螺、海豆芽、水母、海参、海胆、海星、大龙虾等，还有以陈嘉庚先生命名的陈嘉庚水母。

四、鱼类馆：该馆保存的大型鱼类——网纹魟是我国的新纪录种，全国仅我馆保存一尾。有世界上最古老的生物之一，生活在地球上已有5亿多年历史的国家二级保护动物——文昌鱼，有能发电的电鳐、善于跳跃的弹涂鱼、有剧毒的河魨、会钓鱼的鱼——鮟鱇，还有能跃出水面，伸展胸鳍，在空中滑翔的燕鳐鱼及雌雄生理功能颠倒的海马。