蔡忠军同志出生于1949年11月，1970年2月加入中国共产党。 1972年5月于第三军医大学医疗系毕业后在该校附属第一医院肝胆外科工作。先后担任全军肝胆外科中心主治医师、讲师、副教授、教授。1986年1月改任行政领导后先后任该院医教部副主任，院务部部长、第三军医大学校务部副部长、附属三院副院长兼野战外科研究所副所长、院长兼所长及科技管理局局长、党委书记、纪委书记。1995年11月任309医院院长。1991年被批准享受政府特殊津贴。蔡忠军同志在自己的专业和医院管理方面取得了很大的成绩，获得多项科研成果，先后获得四川省科技发明三等奖；国家科技进步三等奖及总后科技成果二等奖两项，三等奖两项。同时,蔡院长还发表过许多科研论著及医院管理方面的文章