菏泽牡丹基因库，2005年创建，主要以收集、保存、开发中国牡丹、芍药新品种为目标，有助于增加物种多样性，丰富遗传育种材料，满足国内外市场的多种消费需求，同时有助于解决牡丹品种同名异物、同物异名等问题，对中国牡丹生产的标准化和花卉产业的规范化、保护稀有牡丹品种具有重要作用。目前已收集不同产地的牡丹2万多株，包括9大色系260多个品种，汇集牡丹品种1000多个、芍药品种400个左右。