副本交换分子动力学模拟(REMD)

概念

副本交换分子动力学模拟(REMD) 在REMD 中，一系列非相互作用的副本系统被重新构建，覆盖了从低温到高温很宽的温度范围。对每一个副本分别进行独立的分子动力学模拟。根据Metropolis 标准，在温度上相邻的每个副本的构型可以进行交换。因此，REMD 模拟可以使低温构型空间逃离局部势能最低点，与传统的动力学相比，REMD 模拟可以在更大的构型空间上取样。但是这个方法的缺点是计算量非常大，副本数目与N成正比，N 是系统的自由度。