1949年5月，中国共产党福州马尾地区工作委员会(简称中共福马工委)成立。福马游击队归中共福马工委领导，在福州城郊和马尾一带开展游击战。福马游击队人数最多时达300多名，林元照任队长兼政治委员。福马游击队是原长(乐)、林(森)边区游击队三大队改编的，吸收福马地区部分青年参加，其中福建省立高级航空机械商船职业学校(简称高航)党支部的8位学生党员奉命参加游击队。同年8月，福马游击队配合入闽的中国人民解放军解放马尾和福州。

州解放后，福马游击队有100多名队员分配在林森(即闽侯)县大队，还有100多名编入长乐县大队。余下的游击队员也给以适当安置。