Mutiple analysis (多点分析)， 在多点分析（mutiple analysis）中，假设M1，…，Mm为m个遗传标记座位，并按正确或假定的染色体顺序排列，对于m个基因座位，一共有m！/2种可能的排列顺序，采用计算机可以同时分析多种基因排列顺序，从而构建一个最佳的连锁图谱。

对于m！/2种可能的基因排列顺序，都可以得到一个各自最大的对数似然值（log-likelihood）。比较这些可能的排列，对数似然值最大者即为最佳的顺序。这种方法就是最大似然法。