遗址位于中山市南朗镇翠亨村东北。原建筑坐西向东，占地279平方米，现存有原殿门框石三块，分别刻有“北极殿”、“灵盛昭水德”和“福曜运天极”门对。另有纪录历次修缮的石碑三块及“北极殿”铁钟一只收藏于孙中山故居纪念馆。北极殿始建于清康熙（1662～1722年）间，殿中供奉有北帝（即北极镇天真武玄天上帝）、金花夫人、天后娘娘3座神像，是翠亨村民祈福的公共场所，也是过去翠亨村的权力中心。孙中山于清光绪九年（1883年）秋与陆皓东一起损坏了北帝像和金花夫人像，以此劝奉村民不要崇拜偶像，被村民认为“大逆不道”、“亵渎神灵”。孙中山的父亲被迫出资重塑金身，孙中山也离村到香港读书。北极殿于“文化大革命”期间被拆除，仅存遗址。“重修翠亨村祖庙碑记”藏于翠亨村孙中山故居内。刻于清道光八年（1828年），用黑麻石阴刻楷书而成，长105厘米，宽66厘米，厚6厘米。碑额每字5厘米，碑文每字1厘米。

“三修翠亨祖庙碑记”镶嵌在翠亨村孙中山故居陈列馆的墙上，刻于清咸丰六年（1856年），用黑麻石阴刻楷书而成。长110厘米，宽67厘米，碑文每字1厘米，碑额每字6厘米。

“四修翠亨祖庙碑记”藏于翠亨村孙中山故居内，刻于清光绪二十年（1894年），用黑麻石阴刻楷书而成，长120厘米，宽77.4厘米，碑额每字5厘米，碑文每字2厘米。