自问世二十几年以来，超声内镜技术的不断进步和功能拓展，使它填补了普通内镜、体表超声和CT等所不能覆盖的一些特殊适应证的空白。扇扫超声内镜能够实时观察及监控穿刺针的前进方向和深度，使内镜超声引导下的FNA得以实现；彩色多普勒和能量多普勒的应用避免了刺穿血管的可能；而超声引导下的细针穿刺活检技术增加了纵轴超声内镜对上消化道和胰腺肿瘤等疾病的检查应用；内镜超声引导下的消化道囊肿造瘘术使引流更精确，减小了出血和穿孔的风险；即使是上消化道很微小的肿瘤内镜超声都能清晰地显示，而且内镜超声对胰腺肿瘤和黏膜下病变的大小和局部浸润范围有良好甚至精确的判断，是其他影像学技术难以比拟的。如今，内镜超声引导下的三大介入技术：内镜超声引导下的细针穿刺吸取细胞学检查、内镜超声引导下的引流技术、內镜超声引导下的细针注射技术的临床应用越来越频繁和广泛。