常熟市疾病预防控制中心是承担全市突发公共卫生事件应急处置、疾病预防与控制、公共卫生监测与技术服务、健康相关产品检测、预防医学检验、健康教育与促进、应用研究与指导的卫生事业机构。

目前，在编职工118人，其中专业人员103人，副高级以上职称20人。中心设有17个职能科室。实验室检测配备有：气相色谱-质谱仪、气相色谱仪、液相色谱仪、离子色谱仪、原子吸收分光光度计、原子荧光光度计、吹扫捕集液体自动进样器、快速溶剂萃取仪、流动分析仪、低本底αβ测量仪、电感藕合等离子体质谱仪、溶剂浓缩仪、总有机碳测定仪、热解析仪、折射仪、自动旋光仪、全自动血液分析仪、全自动生化分析仪、自动细菌鉴定及药敏分析仪、血液锌原卟啉测定仪、甲醛检测仪、测氡仪、紫外可见分光光度计、定量采样机器人、便携式红外光谱气体分析仪、食品安全快速检测箱、水质快速检测箱等。

长期以来，中心贯彻“预防为主”的方针，传染病得到了有效控制，儿童计划免疫通过全国县级第三个85%达标审评；血吸虫病防治获国家卫生部、农业部、水利部颁发的“消灭血吸虫病达标县”奖牌；丝虫病达到了消灭标准；疟疾达到了基本消灭标准；1993年获江苏省计量局颁布的“计量认证”合格证书；2000年被江苏省卫生厅批准为首批艾滋病初筛实验室； 2003年3月获得国家实验室认可；同年获得了江苏省职业病诊断机构、职业卫生技术服务机构、职业健康检查机构资质；2010年获得省疾控认可的集中空调通风系统卫生学评价机构技术评估资质；1983～2010年有19个科研项目分别获省、市科技成果奖；多次获得苏州市、常熟市文明单位称号。