北京市燕山地区国家税务局设11个内设机构（正科级），即办公室、政策法规科、货物和劳务税科、所得税科、收入核算科、纳税服务科、征收管理科、财务管理科、人事教育科（离退休干部科）、监察室、大企业和国际税务管理科；1个直属机构（副处级），即稽查局，下设稽查局综合科、稽查局检查科、稽查局案件执行科、稽查局案件审理科；2个事业单位（正科级），即信息中心、机关服务中心；派出机构3个，即第一税务所、第二税务所、第三税务所。