北京师范大学医学研究院成立于2008年1月，由北京师范大学与第二炮兵总医院联合共建。北京师范大学是一所拥有百年历史的教育部重点直属大学，第二炮兵总医院是中央军委组建的大型综合性现代化医院，担负着临床教学与科研及诊疗康复等军队卫勤保障任务及地方患者的医疗服务。

北师大医学研究院将遵循“共建、共管共同发展”的合作原则，充分发挥双方的地域与资源优势以及学科互补性，立足机制创新、体制创新、军民结合、服务国家社会发展与国防建设，全面开展科学技术集成创新与高层次人才培养，推动双方事业的跨越式发展。

北京师范大学医学研究院是军民战略性互动合作的尝试，对于推动北京师范大学生命科学与技术相关领域向纵深发展和高水平成果创造，以及提升第二炮兵总医院的临床医学水平和创建一流军事医学科学研究和高层次人才培养平台。

北师大医学研究院将充分发挥北师大和二炮总医院双方的地域、资源和学科等方面优势，全面开展科学技术集成创新与高层次人才培养战略合作。在未来的3至5年间，将实现5至6个研究领域的科研实质性合作，4至6个功能性实验室的建设，联合招收一定规模的攻读硕士和博士学位的研究生，使研究院的建设与运行初具规模。北师大医学研究院对于推动北师大生命科学与技术等相关领域向纵深方向发展将具有重大的现实意义。