北京科电微波电子有限公司源于中国科学院电子学研究所所办北京科电微波电子公司。 北京科电微波电子公司创建于1993年5月，成立之初的功能主要是实施国家特别批准的中国科学院电子学研究所及其下属企业的进出口权。1994年电子所5、6、7、8、9共五个研究室以及高技术公司医疗仪器部、电子工程部等成建制调整进入科电微波电子公司，科电微波电子公司开始实体化发展的新阶段。经过多年良好的运行，北京科电微波电子公司于2002年10月完成改制，成立了北京科电微波电子有限公司。

北京科电微波电子有限公司以电子所的技术为背景，以科技人员为主体，充分发挥其在激光技术、红光技术、LED应用技术、电子工程技术、真空技术等领域的特色优势，构成电子所产业化工作的重要组成部分。氩离子激光、CO2激光、铜（金）蒸气激光、红光系列产品、加速器专用电子枪、LED应用和智能控制等技术和产品在国家庆典，绿色照明，医疗卫生，高技术出口等社会和经济活动中均有良好的表现和前景。

北京科电微波电子有限公司坚持与时俱进，开拓创新，务实发展，大力推进科技成果的转化，进一步加快产品化、产业化、规模化的进程，进一步开展社会化、国际化合作，力求用新的机制、新的思路，迎来新的突破、新的发展。