安徽医科大学临床药理研究所创建于1984年。1985年起即为安徽省重点学科；1986—1998年为国家卫生部临床药理基地；1990年获得药理学博士学位授权点；1992年获全国高校先进实验室；2003年成为安徽省首批皖江学者特聘教授设岗单位；2003年成为国家人事部药学博士后科研流动站；1999年起为国家药品临床研究基地；2004年起为抗炎免疫药理学安徽省重点实验室；2005年起为安徽省中药研究与开发重点实验室主要组成单位。2005年被批准为安徽省高等学校首批科技创新团队（中药抗炎免疫药理学）。2007年起为抗炎免疫药物安徽省工程技术研究中心。 2008年起为抗炎免疫药理学省部共建教育部重点实验室。2008年起成为安徽省A类重点学科（药理学）。2008年起成为安徽省抗炎免疫药物基础与应用研究“115”产业创新团队。2008年起成为国家中医药管理局中医药科研三级实验室。

现有博士生导师 4 名，硕士生导师 5 名。