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词条 mirbase
释义

2011年11月4日(北京时间),Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至18.0版。在新版本中,发夹前体序列升至18226条,新增1488条;成熟miR和miR*产物共21643条,新增1929条;新版本报道序列共涵盖个168个物种。

miRBase序列数据库是一个提供包括miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供便捷的网上查询服务,允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息,详情请访问。

2011年11月4日(北京时间),Sanger microRNA序列数据库(miRBase)升级至18.0版。在新版本中,发夹前体序列升至18226条,新增1488条;成熟miR和miR*产物共21643条,新增1929条;新版本报道序列共涵盖个168个物种。从之前的版本(17.0)开始,miRBase一直致力于对成熟序列进行重命名,用-5p/-3p命名法取代miR/miR*命名法。本次更新过程中大约对将近1400条成熟序列进行了重命名,涵盖人、小鼠和线虫3个物种。斑马鱼互补miRNA(miRNA complement)发生了很大的变化,依据Zv9基因组拼装对收录序列进行了合理的调整,删除了26条斑马鱼序列,并新增了12条代表重复基因位点的序列。新增miRNA序列动物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增103条,Mus musculus [小鼠]新增21条,Oryzias latipes [青鳉]新增152条。植物物种中增长最为显著的是Medicago truncatula [蒺藜苜蓿]新增260条,Glycine max [大豆]新增159条,Oryza sativa [水稻]新增90条,Arabidopsis thaliana [拟南芥]新增59条。

此外 ,新版本中首次收录的物种共有15个。 囊泡藻界:Phaeodactylum tricornutum [三角褐指藻] (13)

 7个动物物种: Anolis carolinensis [绿安禄蜥] (282), Macropus eugenii [尤金袋鼠] (2),Sarcophilus harrisii [袋獾] (67),Rhipicephalus microplus [微小扇头蜱] (24),Ascaris suum [猪蛔虫] (97),Glottidia pyramidata (1),Terebratulina retusa (1)。 6个植物物种:Cucumis melo [甜瓜](3),Acacia auriculiformis [大叶相思] (7),Acacia mangium [马占相思] (3),Salvia sclarea [熏衣苏草] (18),Bruguiera cylindrica [柱果木榄] (4),Bruguiera gymnorhiza [木榄] (4)。

 病毒:Herpesvirus saimiri strain A11 (3)。联川生物- LC Sciences中国公司全球首家提供最新18.0版microRNA微阵列芯片检测服务,为您分析最全面的microRNA表达谱。获取更多信息

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更新时间:2024/11/16 7:48:23