应用CTC进行活菌计数时，由于细菌呼吸活动时的电子递质的作用，CTC被还原成CTF（CTC formazan），并在细胞内形成荧光沉淀，该沉淀物不溶于水，其在荧光显微镜下发红色荧光。从理论上看，CTC方法的原理是利用活细胞的呼吸作用，因此能比较准确的反应活细菌的数目。而且该方法实验费用较低，适合实验室研究使用。

日本同仁化学研究所（dojindo）的CTC试剂盒（CTC Rapid Staining Kit）能快速灵敏的对活细菌进行检测。已经被很多科研工作者使用来做活细菌的检测试验。