Cot分析 Cot analysis

在两条具有互补碱基顺序的两个单链DNA之间，根据重组为双链分子速度的分析来确定DNA碱基排列的复杂程度和排列折返频度，这种分析方法称为Cot分析。其反应速度与DNA的浓度成正比。若DNA样品中碱基顺序有重复，则重组速度就与重复频率成正比地增加。1968年R.J.Britten和D.E.Kohne按此原理，作为对含大量各种碱基重复序列的高等生物DNA结构分析的一种手段，提出了Cot分析。设DNA浓度为C，反应时间为t，速度常数为K，DNA链的重组速度v，可用如下的二次函数表示，即：v=dC/dt=-KC2。设DNA的最初浓度为C0，进行积分就成为：C/C0=1/（1+KC0t），（C0-C）/C=KC0t，即在一定时间后，形成双链DNA的量C0-C和残留的单链DNA的量C之比与C0×t成正比。将C0×t作为参数，就称为Cot，将Cot的对数作为横坐标，C/C0作为纵坐标的Cot曲线，对DNA样品中碱基顺序组成的分析，特别是对重复顺序的分析是很有成效的。