半胱氨酸蛋白酶 包括组织蛋白酶B、H、L等，一般存在于溶酶体，主要参与细胞吞噬和细胞内多余物质的清除和消化。近年来组织蛋白酶B（Cathepsin B，CB）的作用日受重视。正常组织中分离到的CB最适PH为酸性，在中性或碱性条件下无活性，但肿瘤组织中CB却在中性或碱性时活性更高，这似乎更适宜于 恶性肿瘤的代谢紊乱。

CB能降解Ⅰ型胶原、LN、PG，并能活化间质胶原酶原和Ⅳ型胶原酶原，降解基质中的Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型胶原纤维。因而参与肿瘤的浸润转移。

Smid L检测喉癌的癌组织和癌旁组织中的半胱氨酸蛋白酶及其抑制剂的浓度，结果发现癌组织中半胱氨酸蛋白酶及其抑制剂的浓度均明显高于癌旁组织中的浓度，表明它们可能参与肿瘤浸润的全过程。