中国科学院海洋环流与波动重点实验室针对海洋环流动力学过程及其气候环境效应，海洋环境的遥感探测与数值预测方法，海洋波动及其对其它海洋过程的影响等方面，开展西太平洋 - 东印度洋环流变异及其对气候变化的影响、中国近海关键环流动力学过程及其环境生态效应、海洋中尺度现象探测、分析与预测、海洋波动与混合的非线性机理、多尺度海洋波动相互作用理论及预测方法、我国沿海重大海洋灾害机理、预测方法和风险评估、海洋遥感机理和海洋要素遥感探测方法、海洋遥感应用、海洋数据同化与数值预报方法等研究，先后主持并承担了一大批“ 973 ”、“ 863 ”、国家自然科学基金、国家专项等重大项目，提出了我国近海环流多项重大科学问题，形成了具有开创性和带动性的以南海黄海冷水团环流、南海暖流、东海冷涡、浙江沿岸上升流、棉兰老潜流等重要科学发现为代表的学术成果，在海洋环流、海洋通量与陆海相互作用、海气相互作用研究方面居于国内领先或先进地位，为我国物理海洋科学诸多方面做出了开创性的贡献。 实验室现有固定研究人员 38 人，其中中国科学院院士2 人，研究员 13 人，实验室主任王凡研究员，学术委员会主任苏纪兰院士。面向国家战略需求和学科发展前沿，实验室重点开展海洋环流动力学过程及其气候环境效应、海洋波动及其对其它海洋过程的影响、海洋环境的遥感探测与数值预测方法等研究。