庚子年(1900年)7月20日，八国联军兵临北京城下。慈禧决定携带光绪等一行人出走西安。此时，大家都换了百姓布衣聚在寿宁宫，“慈禧忽感触前事，出珍妃于牢院。强词珍妃带走不便，留下又恐其年轻惹出是非，因命太监将乐寿堂前的井盖打开，要珍妃自尽，珍妃不肯死。众人遂令太监将珍妃推入井中。”执行此命的是慈禧的领班太监崔玉贵。

民间认为珍妃是因为支持光绪进行戊戌变法而触怒了慈禧太后，但史料对此并无确切记载。目前史学界较赞成的观点是，珍妃因多次违反宫闱禁忌，卖官受贿，再加上光绪皇帝对她情有独钟，冷落了慈禧的亲外甥女隆裕皇后，最终落得被杀害的下场。

1901年春清廷与八国联军媾和，慈禧、光绪等准备还朝。慈禧却天天做着珍妃要来取她命的噩梦，无奈，回到宫中后，便命人将尸骨被打捞出来，装殓入棺，葬于阜成门外恩济庄的宫女墓地，并企图以“贞烈殉节”的名义掩世人耳口。民国二年(1913年)，其姊瑾妃（时为端康皇太妃）将珍妃迁葬光绪景陵妃嫔园寝，并为她修建了一个小灵堂以供奉珍妃的牌位，灵堂上悬挂一额纸匾，上书“精卫通诚”，颂扬珍妃对光绪的一片真情。

珍妃的姐姐瑾妃的结局比她的妹妹强多了。光绪二十六年七月，瑾妃随慈禧也逃出了京城，一年多以后才返回皇宫。光绪帝死后，宣统帝溥仪尊封她为皇考瑾贵妃。1913年3月，溥仪又尊封她为端康皇贵太妃。

据溥仪回忆，隆裕皇太后死后，瑾妃就成为紫禁城内幸存的四妃之首(另外三妃是敬懿皇贵妃、庄和皇贵妃、荣惠皇贵妃，她们三人都是同治帝的妃子)。瑾妃很专权，自己俨然成了皇太后，效法慈禧，让溥仪叫她皇额娘，经常管教溥仪，不把皇帝放在眼中。为此，溥仪在一些人的怂恿下，公开与瑾妃吵了一架，使瑾妃很下不来台，溥仪也为此付出了沉重的代价。瑾妃为了出这口气，把溥仪的奶奶、母亲召进宫，对她二人施加压力。她二人可吓坏了，一齐跪下来苦苦哀求，答应劝溥仪给瑾妃赔礼道歉。最后溥仪经不住祖母和母亲的苦劝，被迫给瑾妃道了歉。溥仪的母亲个性极强，从未受过别人的训斥。这次窝了一肚子火，回到家吞了鸦片烟自杀了。瑾妃听了这个消息以后，吃惊不小，深怕溥仪追究此事，于是也改变了对溥仪的态度，两人关系有了明显地缓和。

1924年10月20日瑾妃病死，终年51岁，溥仪谥之为端康皇贵妃。1925年10月29日葬入崇陵妃园寝东宝券内。

沉井与遇害

有关珍妃之死，史学界大多赞同是慈禧指示亲信太监崔玉贵推其入井的，但是细节方面却不是很清楚，关于这一点，有三部书都曾经进行过比较详细描述。

一是来自金易的《宫女谈往录》，作者自称是崔玉贵的描述：

“到了颐和轩，老太后已经端坐在那里了。我进前请跪安复旨，说珍小主奉旨到。我用眼一瞧，颐和轩里一个侍女也没有，空落落的只有老太后一个人坐在那里，我很奇怪。

珍小主进前叩头，道吉祥，完了，就一直跪在地下，低头听训。这时屋子静得掉地下一根针都能听得清楚。

老太后直截了当地说：‘洋人要打进城里来了。外头乱糟糟，谁也保不定怎么样，万一受到了污辱，那就丢尽了皇家的脸，也对不起列祖列宗，你应当明白。’话说得很坚决。老太后下巴扬着，眼连瞧也不瞧珍妃，静等回话。

珍妃愣了一下说：‘我明白，不曾给祖宗丢人。’

太后说：‘你年轻，容易惹事!我们要避一避，带你走不方便。’

珍妃说：‘您可以避一避，可以留皇上坐镇京师，维持大局。’

就这几句话戳了老太后的心窝子了，老太后马上把脸一翻，大声呵斥说：‘你死在临头，还敢胡说。’

珍妃说：‘我没有应死的罪!’

老太后说：‘不管你有罪没罪，也得死!’

珍妃说：‘我要见皇上一面。皇上没让我死!’

太后说：‘皇上也救不了你。把她扔到井里头去。来人哪!’

就这样，我和王德环一起连揪带推，把珍妃推到贞顺门内的井里。珍妃自始至终嚷着要见皇上!最后大声喊：‘皇上，来世再报恩啦!’”

而一位旧宫监唐冠卿在故宫博物院周刊的“珍妃专号”里则说：“闻珍妃至，请安毕，并祝老祖宗吉样。后曰：‘现在还成话么？义和拳捣乱，洋人进京，怎么办呢？’继语音渐微，哝哝莫辨，忽闻大声曰：‘我们娘儿们跳井吧！’妃哭求恩典，且云未犯重大罪名。后曰：‘不管有无罪名，难道留我们遭洋人毒手么？你先下去，我也下去！’妃叩首哀恳，旋闻后呼玉桂（即崔玉贵），桂谓妃曰：‘请主儿遵旨吧！’妃曰：‘汝何亦逼迫我耶？’桂曰：‘主儿下去，我才下去呢！’妃怒曰：‘汝不配！’忽闻后疾呼曰：‘把她扔下去吧！’遂有挣扭之声，继而怦然一响，想珍妃已堕井矣！”

第三段资料出自《晚清宫廷生活见闻》中一位太监的描述：

“听说珍妃被害的事已经有很多人写过。我们过去同人中一位叫王祥的是亲眼看见珍妃被丢到井里去的。以下是王祥在几年前对我讲的话。

王祥那个时候才二十几岁，他清楚的记得，庚子年七月二十日，宫里乱七八糟的，西太后和光绪皇上都改变了装束，就要逃出宫了。就在这当儿，她亲自率领瑾妃和御前首领太监崔玉贵，王德环到了宁寿宫，把珍妃从三所（囚禁珍妃的住所）里提了出来。

珍妃在这里不知道已经受了多少折磨。她被提到西太后跟前，我们从门缝里看到她，战战兢兢，憔悴的样儿。

西太后究竟同她说了些什么，王祥没有听见。后来在场的太监们传说，西太后对她说，现在太后同皇上就要离京了，本来想带她走，但是兵荒马乱的年月，万一出了什么事，丢了皇家的体面，就对不住祖宗了，让她赶快自尽。还听太监们传说，珍妃对西太后说，皇上应该留在北京，但是还没等珍妃说明道理，西太后就冷笑了一声，抢白她说，“你死在眼前，还胡主张什么。”

这些传说是不是实情，王祥说不能判断。当时王祥从门缝里只看到珍妃跪在西太后面前，哀求留她一条活命，口里不断呼叫“皇爸爸，皇爸爸，饶恕奴才吧！以后不再作错事了！......”西太后气狠狠地呼喝：“你死去吧！"

在场的人，有的眼里流着泪，像木鸡似得呆站着。大概谁也不忍下手。光绪和瑾妃也眼泪汪汪的。

西太后怕时间耽搁久了，就接连着喊叫，快点动手。崔玉贵走上前去，把珍妃扯过去，连挟带提地把她丢到井里去。

珍妃临危前，王祥还听到她呼唤“李安达，李安达！”安达是对太监的尊称。这是珍妃呼唤李莲英，求他救救她。

西太后就是这样残酷地把珍妃害了。”

这三段资料虽然在细节方面大有不同，可在慈禧处死珍妃的理由上却十分一致，那就是以时局纷乱为借口将她推入井的，这应该是珍妃之死的一个真相。