康熙二十三年（1684年）攻克台湾。康熙皇帝由郑氏那里了解到对日贸易的众多好处，于是清政府于1685年正式废除了《迁海令》 ，颁布了《展海令》 允许人民出海经商。这一开明的政策致使去长崎的唐船骤增三、四倍以上，互市之盛堪称空前。同年，日本政府则颁布《贞享令》，规定每年去长崎贸易的总额：中国船贸易额不得超过白银六千贯，荷兰船不得超过三千贯。贸易总额超过白银六千贯后，即禁止此后该年入港的其他中国船舶进行贸易，勒令运回货物。故来得较晚的中国商船常被禁止入港，不得不驶回中国，不过不少中国船就在日本沿海进行走私贸易。康熙二十七年（1688年）赴日唐船达117艘，而该返回中国而从事走私贸易的船达22艘。1698年日本政府限定赴日贸易的唐船为80艘。直至1715年，为防止日本产铜原料之外流，幕府公布《正德新令》，限止每岁赴日唐船为30艘，此令一出，唐船抵长崎者自行减少。唐船贸易的衰落主要还是因为日本幕府的正德新令的限制，而非康熙的禁海。