巴拿巴福音是一本之前从来未被基督教人士知道的书本。这卷书最近在伊斯兰教圈子里广为留传，原因是它的内容支持了伊斯兰教和基督教教义上根本的差别。这书卷的原稿现已失传，但世上还有两个译本留传：当中的意大利文译本原稿还留在世上，并由奥地利的一家图书馆保存；而西班牙文的原稿业已于18至19世纪时遗失，但1970年代雪梨大学的Fisher Library突然发现自己收藏了一份手抄本。现时该手抄本仍存放于图书馆内。

与基督的区别

争议

与巴拿巴书的区别

与基督的区别

巴拿巴福音从来未被基督教的正典、次典或伪经里被引用过。不过，现存的意大利文抄本除了有着西班牙文抄本没有的章节标示以外，在部份书页的边边还抄有书卷内容的阿拉伯文简译。因此，当穆斯林发现这书卷的阿拉伯文译文之後，即时为它出版，以支持他们教义里与基督教观点相左的地方。当中包括以下几点：

书卷里明文提及穆圣的来临，以及耶稣并非弥赛亚，而不过是一位“拯救的先知”；而他的救赎也只限于以色列人，并不包括外邦人。在书卷第42章有这段内容：“耶稣招认了，并讲出真相：“我不是弥赛亚。’”，其後再在的第97章有这样的内容：“有祭师问：‘那将要来的弥赛亚叫甚么名字？’(耶稣答：)‘他的圣名叫穆罕默德’”。

根据圣经四福音的记载，耶稣基督曾被钉死在十字架上，并且在复活之後40天在门徒和其他信徒面前升天。但在这书卷里，并没有提及过耶稣被钉死在十字架的内容，反而形容他像列王纪下第2章里提及以利亚被天使驾马车接上天国的描述类似。

由于巴拿巴是耶稣基督的十二位门徒之一，所以穆斯林认为他的作品理所当然的比他的徒孙、保罗的门徒马太、马可、路加和约翰来得正宗。(但其实马太和约翰都是耶稣的门徒，反而巴拿巴是耶稣升天时才相信耶稣基督就是主，而且马可在与保罗分开之後，可是跟从巴拿巴一起去传道的。)

不过，虽然有穆斯林曾作出这种声称，但巴拿巴福音的内容与古兰经的内容并不相符。

另一方面，本书卷的内容亦有不少无知的错误，例如：

巴拿巴驾船前往拿撒勒(但拿撒勒却是内陆地方，和加利利湖有一段距离)

书卷指耶稣基督在本丢彼拉多管治期间出世，但彼拉多却在公元26年出任犹太省的首长，显然与耶稣在公元前後的日子出生的说法相矛盾。

争议

对本书卷有研究的基督教学者认为，本书卷是中世纪时穆斯林所伪造的，目的是要宣扬伊斯兰教。他们指出，巴拿巴的用词与《但丁》的用词非常相似，很可能是原作者以《但丁》为编写蓝本。另一方面，根据旧约圣经《利未记》第25章提及，在七个七年之後的第50年“第五十年你们要当作圣年、在遍地给一切的居民宣告自由，这年必为你们的禧年、各人要归自己的产业、各归本家。第五十年要作为你们的禧年，这年不可耕种、地中自长的、不可收割，没有修理的葡萄树、也不可摘取葡萄。”(利25:10-11)但书卷里却指禧年每一百年一次。这很明显是因为公元1300年教宗博尼法修八世宣布禧年改为每一百年一次而造成的错误。

与巴拿巴书的区别

请勿把本书卷与伪经巴拿巴书信混淆。巴拿巴书信成书于公元2世纪的亚历山得拉港。这两本书卷无论在风格、内容和历史方面都完全不相干。在割礼方面，两位作者的分歧就更明显：巴拿巴书信依从《使徒行传》中信徒不需要守犹太教徒的割礼，但巴拿巴福音却坚持伊斯兰教的信仰，认为应该要守割礼。