1、福建省莆田市笏石镇玉山书院

2、陕西省蓝田县玉山书院

3、台湾台南县玉山书院

1、福建省莆田市笏石镇玉山书院

玉山书院位于笏石镇坝津村与西徐村交界的徐厝自然村境内。据说，徐厝村乃由城郊延寿村的徐寅（唐乾宁894年状元）后裔迁居而来的，该村的后面山坡上现存有徐寅的坟墓遗迹。

徐氏家族在此繁衍生息后，建起“徐氏祠堂”，又建起城山宫（廿八乡铺宫）。再在此宫殿的左侧建造“玉山书院”。内有四中柱，规模不小，奉祀文昌帝君及孔子神像。厥后，聘请来秀才塾师，授徒课业，儒学之风日益兴盛。徐家雅士墨丁，代有人在。

20世纪50年代初期，徐氏祠堂及玉山书院遭焚，成一片废墟。80年代中期，城山宫恢复香火。1995年重建玉山书院于原址，屋宇坐东朝西，遥望巍峨壮观的壶公山，风光无限。

2、陕西省蓝田县玉山书院

玉山书院位于陕西省蓝田县。清乾隆四十一年(1776)，知县阮曙创建。有大门5间，厦房6间，二门、讲堂、上房各5间，东西诸生肄业房30间。束修以及肄业生童膏火奖赏之费均由阮捐俸劝募补助。后废。五十九年知县马学赐重新整顿，延师掌教，立课程。嘉庆元年(1796)后，主课久虚。至八年，知县庄达吉捐廉，设40名生童膏火，并立《考课规条》10条，重又规定每月大课2次，师课2次，科场年每月加课1次。大课取前10名者给奖赏银，不到者须请假。考课内容、时间、考场、纪律等均作明确规定。后又废。道光七年(1827)知县罗定约亲为课士，优加奖赏，士气为之一新，其时学额8名。十四年，知县胡元煐筹地68亩以助山长修脯资，添建报功祠，祀历代创建书院有功之人。十六年制订《肄业生童章程》12条。对生童膏火发放，考课时间、内容，奖赏名额、办法等又作规定。此时生童正课定额各8名，附课定额各12名。同治九年(1870)知县吕懋勋以书院迫近官署，公廨讼庭鞭扑声与书院弦歌声相闻，遂改书院为考院，另于城西门大街买房屋，别立书院。建大门、讲堂各5间，东西厢房各2间，后厢房4间，上房5间，共19间。制订《书院条规》，光绪二十八年(1902)，知县周之济复改考院为书院。同年，又改为高等小学堂，改西门大街书院为习艺所。

3、台湾台南县玉山书院

玉山书院位于台湾台南。清咸丰元年(1851)创建。同治元年(1862)毁。六年吴志高、林威等募款重建。其规模在台湾的书院中为最小，只招聘讲师1人，选举管理员1人。购置学田100余亩以充其经费来源。已废。