吴亿年，汉族，1962年生，福建同安人。现任厦门市教育局副局长。

福建师范大学硕士研究生毕业。福建省特级教师，国家级骨干教师，福建省中小学学科带头人，厦门市专业技术拔尖人才。曾获福建省中学物理优质课观摩大赛二等奖，福建省中学物理说课比赛一等奖，全国中学生物理竞赛辅导奖。担任三届班主任（含年段长），两届获厦门市理科状元，一届获福建省理科状元；任教班级均分均为市第一名，其中一届获市单科第一名，一届获省物理单科第一名。主持国家级、省市级科研课题研究，多篇论文在CN刊物发表，并收入中国人民大学资料中心。自制教具获教育部组织的全国第六届教学仪器大赛一等奖。获中宣部、教育部、文化部、中央党校、广电总局、全国妇联、团中央联合颁发的“青少年文明礼仪教育标兵”称号。任福建省普通高中示范性学校专家评委，福建师范大学兼职副教授，厦门市物理协会副理事长。福建省第十、第十一届人大代表，厦门市第十一届人大代表、科教文卫委员，2005年任厦门市同安一中校长（正处级），兼任厦门市同安区第十三、十四、十五届人大常委会副主任（副局正处级）。

2011年10月11日，任厦门市教育局副局长（副局正处级）。