微生物源性致癌物是微生物的致癌性代谢产物。包括两类：①真菌毒素，已鉴定的致癌性毒素见附表。②抗生素(antibiotics)，除氯霉素(chloramphenicol)和灰黄霉素(griseofulvin)为抗菌药物外，其余为抗肿瘤药物，如放线菌素类(actinomycins)、丝裂霉素(mitomycin C)、阿霉素(adriamycin)、正定霉素(daunomycin)、洋橄榄霉素(elaiomycin)、乙硫氨酸(ethionine)、氮丝氨酸(azaserine)、亚硝基去甲烟碱(nitrosonornicotine)及链脲霉素(streptozotocin)等。国际致癌研究所(IACR)提出黄曲霉毒素和氯霉素为人类可疑致癌物（证据有限）。人类肝癌可能与黄曲霉毒素有关。据报道，经氯霉素治疗后出现骨髓抑制的病人可发生白血病，而灰黄霉素可致小鼠肝癌。