微波脱硫是一种正在研究中的脱硫方法。高硫煤在微波频率的电磁场作用下，硫键（Fe－S或C－S）可选择性地吸收大量能量而产生高活性的硫，但微波能量不能加热媒质本身。因此既不能破坏媒质又可在50-150℃之间使；硫键断裂。生成的游离硫可与煤中的氢、氧进行反应，生成H2S、SO2或COS等气体，从煤中析出。选择某一特征的微波频率是脱硫的关键。根据我国实验结果，频率在8.35-8.40千赫之间时，媒质与微波作用较为强烈。不仅可脱除黄铁矿硫，也能除去有机硫。有机硫在高温下分解为H2S等挥发性硫化合物而与煤分离。脱硫率几乎可达100%。但如何降低成本和挥发性硫化合物的回收等问题尚需进一步研究。