水生毒理学是研究污染物与水生生物和环境因素之间相互作用的科学，是毒理学的分支学科。各种污染物从不同途径进入水体，降低水产品质量，引起大批鱼、贝类死亡，并威胁人体健康，从而引起人们的重视和研究。它是生态毒理学中比较活跃的研究领域。主要研究毒物对水生生物的毒性毒理学影响，毒物在水生环境中的迁移、转化与归宿及其与环境因素之间的相互作用。采用常规的毒性实验，室内微宇宙（microcosm）及野外受授生态系统（mesocosm）的实验观测，并采用微量化学分析和数学模拟技术。研究结果对于制定渔业水质标准、污水排放标准、水质评价及化学品安全评价等都有重要的实际意义。