水产业结构是水产业各部门的组成情况，即水产捕捞业（包括海洋捕捞业和内陆捕捞业）、水产养殖业（包括海、淡水养殖业）、水产种植业、水产采集业和水产品冷藏保鲜加工业在水产业总产值中所占比重。可反映水产业各部门的比例关系、协调程度和空间布局。水产业结构合理与否，直接影响到水产资源的合理利用、水产业的发展速度及其经济效益。其主要研究内容有：①从建立良性的渔业生态体系出发，调查和评价影响水产业生产的自然、技术、经济条件；②研究分析水产业总体结构的现状、特点及其演变过程，探索其合理的比例关系；③研究水产业的潜力、问题与发展途径；④提出调整水产业结构的合理方案。合理的水产业结构应达到：水产资源得到充分、合理、有效的开发利用；各部门及其内部协调发展；尽可能满足不同层次对各种水产品的需要。为促使一国、一地区水产业的稳定发展，必须对现有的水产业结构加以调整，其主要原则为：有利于保护各类水产资源，加强生产的薄弱环节，如海水养殖业、冷藏保鲜加工业等，提高资源的利用率和经济效益。