把基因组中含有特定碱基序列的噬菌体，通过与RNA或DNA杂交，再从多数噬菌体的噬菌斑中选出的方法。将在琼脂培养基上形成的噬菌体的噬菌斑，拓印移于硝酸纤维素滤纸上，再用碱处理将噬菌体粒子破坏使DNA变性，然后使之固定于硝酸纤维素滤纸上，再与用放射性同位素标记的特定的RNA或DNA片段进行杂交，通过放射自显影法来识别含有所需DNA序列的噬菌体的噬菌斑，然后根据其在硝酸纤维素滤纸上的位置从原来的琼脂培养基对应位置处中选出与其对应的噬菌斑。