什麼是生物模型资料库

生物模型资料库是一个免费的生物模型在线资料库。资料库中主要存储数量型生物化学模型。所有的模型都是在相关的科学文章中发表过的并且经过了同行评审。

所有生物模型资料库中的模型都是已经发表在各种学术刊物上的，并且被验证人员用模拟软体模拟验证过的. 所有模型中的元素都被连接到相关参考资料库，方便用户快速获得相关详细信息。

生物学家可以以SBML和CellML两种格式上传生物模型。当模型上传後，会自动转换为以下格式供生物学家下载使用：SBML, CellML, XPP, SciLab, BioPAX和一些图形格式， 如GIF, SVG和applet.

相关机构

生物模型资料库由以下机构合作开发：位于英国剑桥的欧洲生物信息研究所（EBI）的运算神经生物学组(Computational Neurobiology Group)； 美国加利福尼亚Keck Graduate Institute的SBML组和日本Systems Biology Institute以及 JWS Online, Stellenbosch University, ZA.

研发资金来源

生物模型资料库的研发得到以下组织的资助：欧洲分子生物实验室（European Molecular Biology Laboratory）和美国National Institute of General Medical Sciences.

研发资金来源

生物模型资料库的研发得到以下组织的资助：欧洲分子生物实验室（European Molecular Biology Laboratory）和美国National Institute of General Medical Sciences.

外部链结

BioModels资料库官方网站

Le Novère N., Bornstein B., Broicher A., Courtot M., Donizelli M., Dharuri H., Li L., Sauro H., Schilstra M., Shapiro B., Snoep J.L., Hucka M. (2006) BioModels Database: a free, centralized database of curated, published, quantitative kinetic models of biochemical and cellular systems. Nucleic Acids Res., 34: D689-D691.

Le Novère N., Finney A., Hucka M., Bhalla U., Campagne F., Collado-Vides J., Crampin E., Halstead M., Klipp E., Mendes P., Nielsen P., Sauro H., Shapiro B., Snoep J.L., Spence H.D., Wanner B.L. (2005) Minimum information requested in the annotation of biochemical models (MIRIAM) Nature Biotechnology, 23: 1509-1515.

Website of the BioModels.net initiative