深圳产权交易中心由深圳市国土资源和房产管理局土地房产交易中心主办。2004年5月21日，深府办66号文件印发市政府批准的《深圳市知识产权局职能配置内设机构和人员编制规定》，根据该文件，设置深圳市知识产权局（挂深圳市版权局牌子），为市政府主管知识产权事务的副局级直属机构。

主要职能为：

（一）贯彻、执行国家和省、市有关知识产权（不含商标，下同）的方针、政策、法律、法规和规章；拟定知识产权政策、法规和规章，组织研究本市知识产权重大问题，制定全市知识产权发展战略与规划并组织实施；协调指导知识产权保护和创新体系的建立。

（二）组织实施全市知识产权战略，建立知识产权预警机制。

（三）贯彻落实专利优惠政策和措施；负责组织重大专利项目的实施与服务；依照有关规定管理专利申请资助及相关专项经费；归口申报并组织实施国家、省下达的专利技术实施等计划；依法负责深圳地区专利代理机构资质的审核报批及年检工作；归口管理专利奖励；指导本市各级专利工作机构工作；负责专利市场的规范和管理。

（四）负责著作权行政管理工作，监督指导本市著作权贸易活动及著作权集体管理和代理机构工作；审核作品自愿登记。

（五）负责知识产权行政执法工作，依法保护专利权、著作权、企业技术秘密等；依法查处假冒他人专利、冒充专利、著作权侵权等行为与案件；调解知识产权方面的各类纠纷。

（六）负责知识产权工作的对外交流与合作；统筹协调涉外知识产权事务；负责发布全市知识产权重大信息；组织有关知识产权的宣传、培训和统计工作；承担市知识产权保护领导小组的日常工作。

（七）负责本市专利信息发布工作；指导专利信息资源的开发利用。

（八）协调、指导全市知识产权中介服务机构和社会团体与知识产权相关的业务工作；指导、协调区知识产权行政管理工作。

（九）建立、完善与企业对话沟通制度，提高我市知识产权服务水平。

（十）承办市委、市政府和上级部门交办的有关工作。