取样方法即通过调查种群的部分，根据所得数据推广用于估计种群整体的方法。
估算种群密度最常用的方法之一是样方法：在被调查的种群的分布范围内，随机选取若干个样方，通过计数每个样方内的个体数，求得每个样方内的种群密度，以所有样方种群密度的平均值作为该种群的种群密度估计值。
许多动物的活动能力强，活动范围大，不宜用样方法来调查它们的种群密度。常用的方法之一是标志重捕法。也就是在被调查种群的活动范围内，捕获一部分个体，做上标记以后再放回原来的环境，经过一段时间后进行重捕，根据重捕到的动物中标记个体数占总个体数的比例，来估计种群密度。