词性解释

copia因子结构

词性解释

反向末端重复序列invertedterminalrepeat

中名同义词：反转末端重复序列

英名同义词：ITR

定　义：在某些跳跃子末端以反方向存在的类似或相同的短序列.

广　义　词：去氧核糖核酸序列

分　类：生物技术-基因结构

copia因子结构

copia因子长约5kb，末端带有276bp的正向重复。正向重复序列本身的两端又存反向重复。在插入位点产生一个5bp的正向重复序列。在copia家族中的各成员之间的差异很小，一般小于5%；变异体常含有小的缺失。虽然个别成员显示出很大的差异，但这些特点与其它copia一类家族都是共同的。每个copia两端的正向重复序列都是相同的，这意味着在相关的过程中它们可能相互作用，或者二者都是在转座中由一祖先因子的一个正向重复序列产生的。此和Ty因子相似，此表明与反转录病毒的关系。

在基因组中的copia因子总是完整的，单个拷贝的末端重复序列末检测到（虽然我们预期它们如果产生重组的话，会缺失间插DNA）。有时发现copia因子形成了环状的分子。长型的有两个末端重复，而短型的只有一个。含有copiaRNA的颗粒倍受关注。

copia序列含有一个长4227bp的阅读框，阅读框的一部分与反转录病毒的gag和po1序列同源。值得注意的是阅读框中没有与反转录病毒的env序列同源的部分，表明copia和Ty一样不能产生病毒样颗粒。

copia的转录本是丰度poly(A)+的mRNA，它有两种形式，一种是完整长度的转录本，另一种是部分长度的转录本，二者有相同的5末端，这是由于在一个末端重复序列的中部起始转录所致。不同蛋白的产生可能涉及到RNA的拼接以及多肽的剪切。

虽然我们还缺乏copia产生转座的直接证据。但copia有很多与反转录病毒结构相似之处，看来copia必定有一个与反转录病相关的起源。现在很难说明它具有多少多反转录病毒的功能。当然现在是知道它可以转座，但（和Ty因子的情况相似）没有证据表明它们有感染能力。

黑腹果蝇中另一个转座因子家族的成员是称为FB（是折回foldback的缩写），它具有长度不同的反向末端重复序列。有的FB因子仅是由两个紧密相连的反向重复所构成。而另一些两端是反向重复序列，中间有非重复的DNA区域所构成。所有FB家族成员虽然其反向重复序列长短各异，但都是同源的。它们的结构解释了这一特点。即它的反向重复是由相同序列的DNA串联拷贝所组成，被不同的长度DNA序列所隔开。形成了FB的末端，相似序列单位的长度也就增加了，开始有10bp，然后延伸到20bp，最终达到31bp，单个FB因子中的两个拷贝的反向重复序列是不同的。

关于FB因子的末端结构提出一个难题，现在还不知道是什么赋于它们转座的能力。有时两个不相同的FB因子可以协同转座一个大片段间插DNA序列。可能以细菌转座子相似的方式转座（在FB因子之间的DNA的长度可能要此细菌的长得多，有的可达200Kb）。也可能是通过两个末端的FB因子使任何DNA序列折叠成一个单位进行转座。