魔斑核苷酸（magic spot nucleotide）是细菌生长过程中在缺乏氨基酸供应时产生的一个应急产物。主要是三磷酸鸟苷（GTP）合成的四磷酸鸟苷（ppGpp）和五磷酸鸟苷（pppGpp）。主要功能是干扰RNA聚合酶与启动子结合的专一性，诱发细菌的应急反应，帮助细菌在不良环境条件下得以存活。

细菌遇到氨基酸全面缺乏时产生一个应急反应以停止大量基因的表达。产生这一应急反应的信号是鸟苷四磷酸(ppGpp)和鸟苷五磷酸（pppGpp）。因PpGpp与pppGpp的作用不只是一个或几个操纵子，而是影响大批操纵子，故称为超级调控子。又因其电泳的迁移率和一般的核酸不同称为魔斑核苷酸。

科学上，把培养基中营养缺乏，蛋白质合成停止后，RNA合成也趋于停止这种现象称为严紧控制（rel）；反之则称为松散控制（rel）。研究发现，在氨基酸缺乏时，rel菌株能合成鸟苦四磷酸（ppGpp）和五磷酸（pppGpp），而rel菌则不能。

GTP+ATP→pppGpp+AMP→ppGpp

ppGpp的主要作用可能是影响RNA聚合酶与启动子结合的专一性，从而成为细胞内严紧控制的关键。当细胞缺乏氨基酸时产生ppGpp，可在很大范围内做出应急反应，如抑制核糖体和其他大分子的合成，活化某些氨基酸操纵子的转录表达，抑制与氨基酸运转无关的转运系统，活化蛋白水解酶等。