密码子codonm，RNA分子中每相邻的三个核苷酸编成一组，在蛋白质合成时，代表某一种氨基酸。科学家已经发现，信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。也就是说，信使RNA分子中的四种核苷酸(碱基)的序列能决定蛋白质分子中的20种氨基酸的序列。碱基数目与氨基酸种类、数目的对应关系是怎样的呢？为了确定这种关系，研究人员在试管中加入一个有120个碱基的信使RNA分子和合成蛋白质所需的一切物质，结果产生出一个含40个氨基酸的多肽分子。可见，信使RNA分子上的三个碱基能决定一个氨基酸。

定义

特点

遗传密码的起源

用于科普游戏的语言版密码表(语法及举例)

定义

科学家把信使RNA链上决定一个氨基酸的相邻的三个碱基叫做一个“密码子”，亦称三联体密码。

构成RNA的碱基有四种，每三个碱基决定一个氨基酸。从理论上分析碱基的组合有4的3次方=64种，64种碱基的组合即64种密码子。怎样决定20种氨基酸呢？仔细分析20种氨基酸的密码子表，就可以发现，同一种氨基酸可以由几个不同的密码子来决定，起始密码子为AUG(甲硫氨酸) ， 另外还有UAA、UAG、UGA三个密码子不能决定任何氨基酸，是蛋白质合成的终止密码子。1994年版曾邦哲著《结构论》中对密码子和氨基酸的组合数学计算公式为：C1/4+2C2/4+C3/4=20氨基酸，C1/4+6（C2/4+C3/4）=64密码子。

遗传信息、密码子、反密码子的区别与联系

遗传信息是指DNA分子中基因上的脱氧核苷(碱基)排列顺序，密码子是指信使RNA上决定一个氨基酸的三个相邻碱基的排列顺序，反密码子是指转运RNA上的一端的三个碱基排列顺序。其联系是：DNA(基因)的遗传信息通过转录传递到信使RNA上，转运RNA一端携带氨基酸，另一端反密码子与信使RNA上的密码子(碱基)配对。

特点

①. 遗传密码子是三联体密码：一个密码子由信使核糖核酸（mRNA）上相邻的三个碱基组成。② 密码子具有通用性：不同的生物密码子基本相同，即共用一套密码子。

③ 遗传密码子无逗号：两个密码子间没有标点符号，密码子与密码子之间没有任何不编码的核苷酸，读码必须按照一定的读码框架，从正确的起点开始，一个不漏地一直读到终止信号。

④ 遗传密码子不重叠，在多核苷酸链上任何两个相邻的密码子不共用任何核苷酸。

⑤ 密码子具有简并性：除了甲硫氨酸和色氨酸外，每一个氨基酸都至少有两个密码子。这样可以在一定程度内，使氨基酸序列不会因为某一个碱基被意外替换而导致氨基酸错误。

⑥ 密码子阅读与翻译具有一定的方向性：从5'端到3'端。

⑦有起始密码子和终止密码子，起始密码子有两种，一种是甲硫氨酸（AUG），一种是缬氨酸（GUG），而终止密码子（有3个，分别是UAA、UAG、UGA）没有相应的转运核糖核酸（tRNA）存在，只供释放因子识别来实现翻译的终止。

在信使RNA中，碱基代码A代表腺嘌呤，G代表鸟嘌呤，C代表胞嘧啶，U代表尿嘧啶（注意：RNA与DNA不同，RNA没有胸腺嘧啶T，取而代之的是尿嘧啶U，按照碱基互补配对原则，U与A形成配对）。

遗传密码的起源

除了少数的不同之外，地球上已知生物的遗传密码均非常接近；因此根据演化论，遗传密码应在生命历史中很早期就出现。现有的证据表明遗传密码的设定并非是随机的结果，对此有以下的可能解释:

最近一项研究显示，一些氨基酸与它们相对应的密码子有选择性的化学结合力，这显示现在复杂的蛋白质制造过程可能并非一早存在，最初的蛋白质可能是直接在核酸上形成。 原始的遗传密码可能比今天简单得多，随着生命演化制造出新的氨基酸再被利用而令遗传密码变得复杂。虽然不少证据证明这观点，但详细的演化过程仍在探索之中,。 经过自然选择，现时的遗传密码减低了突变造成的不良影响。

尼伦伯格（M.W.Nirenberg，1927—）和马太（H.Matthaei)破译出了第一个遗传密码。

尼伦伯格和马太采用了蛋白质的体外合成技术。他们在每个试管中分别加入一种氨基酸，再加入除去了DNA和mRNA的细胞提取液，以及人工合成的RNA多聚尿嘧啶核苷酸，结果加入了苯丙氨酸的试管中出现了多聚苯丙氨酸的肽链。实验结果说明，多聚尿嘧啶核苷酸导致了多聚苯丙氨酸的合成，而多聚尿嘧啶核苷酸的碱基序列是由许多个尿嘧啶组成的（UUUUUUUU......），可见尿嘧啶的碱基序列编码由苯丙氨酸组成的肽链。结合克里克得出的3个碱基决定1个氨基酸的实验结论，与苯丙氨酸对应的密码子应该是UUU。在此后的六七年里，科学家沿着蛋白质体外合成的思路，不断地改进实验方法，破译出了全部的密码子，并编辑出了密码子表。

用于科普游戏的语言版密码表

首先，这个不是生物的事实。而是基于已有的20个必需氨基酸首字母缩写，添加缺如的6个字母后得到的。

依次根据氨基酸三字母缩写，中文译名拼音首字母寻找相关，再以其中密码子简并性（即重复性）最强的氨基酸为首选进行替代，具体变换为：

GCA,GCG: A→B

AGA,AGG: R→J

CCA,CCG: P→O

UUA,UUG: L→U

GUA,GUG: V→X

CAC : H→Z

对终止密码子亦进行了调整。

需要强调，这一编码方案忽略了既有的B、Z的使用，以及忽略了终止密码子间真实的强弱性。

正向翻译备选方案

A: GCU, GCC.

B: GCA, GCG.

C: UGU, UGC.

D: GAU, GAC.

E: GAA, GAG.

F: UUU, UUC.

G: GGU, GGC, GGA, GGG.

H: CAU.

I: AUU, AUC, AUA.

J: AGA, AGG.

K: AAA, AAG.

L: CUU, CUC, CUA, CUG.

M: AUG.

N: AAU, AAC.

O: CCA, CCG.

P: CCU, CCC.

Q: CAA, CAG.

R: CGU, CGC, CGA, CGG.

S: UCU, UCC, UCA, UCG, AGU, AGC.

T: ACU, ACC, ACA, ACG.

U: UUA, UUG.

V: GUU, GUC.

W: UGG.

X: GUA, GUG.

Y: UAU, UAC.

Z: CAC.

起始符：AUG【与M的编码相同，但之后需加空格□（UAA）】

空格□：UAA

断句符：UAG

终止符：UGA反向翻译：见图“修改后的密码表”

语法及举例

语法：

a.以AUG表示进入正式信息编码区;

b.空格 (□) 用 UAA;

c.逗号或其它文章内断续标点用 UAG;

d.编码结束（最后一个句号）用 UGA表示;

e. 默认为表达英语，如果需要表达其它语种，可以在起始信号（5'端）前延长6个碱基，编码语言使用语言的国家双字母缩写，如拼音加注CN，日语假名罗马体加注JP等。

举例：

通用语言：I love U.

中转：(Start)□I□love□U.

最终的核酸语言：AUG UAA AUU UAA CUG CCA GUC GAA UAA UUA UGA

可以和连鹤或串珠等实体结构结合来进行空间变换，加强教学效果。但需要使游戏者谨记这套密码系统是修改过的。