Sextama框:

原核生物启动子上-35bp处的TTGACA区,又称-35区.

间隔区:内部无明显的保守性,其序列的碱基组成对启动子的功能不十分重要,但其长度却是影响启动子功能的重要因素.

对于大多数启动子来说,在RNA聚合酶覆盖的部分还有一个重要的区域,叫做Sextama框,其位置在-35附近,因此又叫-35序列(右图),其一致序列为:T82T8４G78A65C54A45。－35序列是RNA聚合酶初始结合位点,RNA聚合酶依靠其σ亚基识别该位点,因此又称为RNA聚合酶识别位点。其实验证据是,当RNA聚合酶所保护的片断提纯以后再加人RNA聚合酶,二者仍能很好地结合；但在加RNA聚合酶之前,用Hind Ⅱ在-35序列上切断DNA,则RNA聚合酶就不能结合。同时,目前已经发现的影响启动子活性的若干突变体的突变位点集中在-35序列中和-10序列附近(下图)。可见这是两个重要的位点。

－40　－30　－20　－10　＋1 GGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTG　↓↓↓　↓　↓↓

A　A　A　A　A　▲表示碱基缺失RNA聚合酶先结合于-35序列,然后才结合于-10序列。