昆明医学院二附院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的大型综合性医院。始建于1952年，原名“昆明市工人医院”，1962年更名为昆明医学院第二附属医院，2000年挂牌第二临床学院。1993年1月首批被国家卫生部评定为“三级甲等医院”，是“全国百佳医院”和卫生部指定的国际紧急救援中心（SOS）网络医院。

医院现有职工1406人，其中高级职称311人；有博士学位授权专业1个，硕士学位授权专业26个，博士、硕士生导师74人；有国家“百千万人才”1人，云南省中青年学术和科技带头人后备人才4人，享受国务院特殊津贴12人，获云南省有突出贡献的优秀专业技术人才13人，享受省政府特殊津贴8人，获全国卫生系统先进工作者称号2人。

医院占地面积101.3亩，改扩建后总建筑面积25万㎡，其中直接用于教学和学生公寓的建筑面积为11748.14㎡。有10万元以上大型医疗设备近200台(套)。编制病床1200张，年门诊病人70.33万余人次，年住院病人3.85万人次。设有56个临床和医技科室、15个教研室、云南省继续医学教育基地9个，承担了本科生、研究生的临床教学、实习及基层医院医师进修和全省社区全科骨干医生培训的教学任务。

医院建有5个省级研究所，9个省级研究中心，6个云南省临床重点专科和1个省级研究室，是云南省伽玛刀临床治疗中心、国家药物临床试验基地、云南省化学中毒救治基地和住院医师规范化培训基地。近几年来，承担国家自然科学基金12项，攻关项目2项，国际合作1项，承担厅级以上科研课题170项。获科研成果奖66项，其中获卫生部科技成果三等奖1项、中华医学科技奖1项、省科技进步一等奖2项，出版专著57部，SCI收录论文9篇。

医院高度重视学科建设、人才培养和对外交流合作工作，与美、法、德、日、澳、泰、芬、瑞、新加坡、香港等10多个国家或地区的医院有着广泛的科研合作、人才培养协议及国际学术交流。近年来，医院通过组织全院中层以上干部赴新加坡、泰国等多个国家进行国际化管理培训，使医院的学科建设和人才培养整体水平得到提升。