克孜尔水电站是一座带有年调节水库的坝后式水电站（水库不属电厂所有），原装机为4×6500kW的水轮发电机组，总装机容量2.6万千瓦，年利用小时5154小时，年设计发电量为1.34亿千瓦时。2006年两台机组增容改造，现总装机容量为3万千瓦。电厂主体工程于1985年动工，1991年10月第一台机组发电，1992年7月第二台机组发电并网，1993年5月第三、四台机组发电。1993年8月1日阿克苏地区东西片通过克孜尔水电站实现并网，为阿克苏地区提供优质电能，改善了供电区的供电质量，缓解了阿克苏地区的电力紧张状况。

克孜尔水电站由新疆新华水电投资股份有限公司克孜尔电厂负责运营和管理。