九龙海关是深圳海关的前称，始建于1887年（清光绪十三年）。 第一次鸦片战争失败后，香港沦为英国殖民地。清政府希望能制止鸦片走私，增加税收，便委托海关总税务司赫德（英籍）与英政府会商。当时的英政府企图解除中方对香港的“封锁”，方便其商品倾销中国。而受帝国主义指派控制中国海关的赫德，则企图借会商夺取常关征税权，扩大其把持的洋关权力，为英政府服务。

在这种情况下，赫德以牺牲中国的权益为代价，向英方妥协，商定由中国政府在中港边界设立一个由总税务司署管辖的海关，专司稽查鸦片税厘和查缉走私事宜。因当时九龙半岛新界部分尚未被英国侵占，故该关定名为“九龙关”。

九龙关从建立之日起，其管理权就一直由外国人控制，62年间，九龙关任命了66任税务司和代理税务司，全部为英国人；其他重要职务（帮办、监察长等），也绝大多数由洋员包揽，忠实地为帝国主义利益服务。

1949年10月，人民政权在深圳成立九龙关接管委员会，接管了九龙关设于边境的所有关卡和缉私总部。在中共地下组织的策动下，九龙关总关同时在香港宣布起义。随后，总关机构陆续撤回深圳，仍称“九龙关”。1950年1月，海关总署决定将“九龙关”更名为中华人民共和国九龙海关。保留“九龙”这个关名的意义，在于显示中国人民维护国家主权和领土完整的决心。

人民政权接管九龙关后，即对海关机构和制度进行根本性的改革，废除为帝国主义利益服务的法规，改造成为为人民服务的海关。九龙关从此结束了60多年一直由帝国主义把持的历史。当时的国家主席刘少奇高兴地说：“我们已把中国大门的钥匙放在自己的袋子里，而不是如过去一样放在帝国主义及其走狗的袋子里。”

直到1997年香港回归祖国怀抱，九龙海关才更名为中华人民共和国深圳海关。