吉首大学分吉首校区和张家界校区，吉首大学张家界学院也是分吉首校区和张家界校区。原因很简单，张家界学院在教学设施和队伍上要依托吉首大学。

吉首大学张家界学院是吉首大学按新模式、新体制建立的独立学院。吉首大学张家界学院在招收自己的学生后，又把学生转交给吉首大学相关专业的学院托管，每年交一定的所谓托管费。张家界学院在教学设施和队伍上要依托吉首大学。

吉首大学本部在吉首，吉首大学张家界学院在张家界。

吉首大学张家界校区和吉首大学张家界学院最大的区别在于，张家界校区是属于吉首大学分校区，在招生层次上为二本，属吉首大学本部管辖，现今主要有旅游与管理工程学院、外国语学院、城乡资源与规划学院、美术学院、软件工程学院、民族预科学院。而张家界学院属于独立法人，为吉首大学下设的二级学院，在招生层次上为三本，独立管辖，只是依托于吉首大学的教学资源。

张家界校区共有教学楼3栋，宿舍区共有宿舍10栋，分布在校区西北方向。宿舍区距离食堂、图书馆以及运动场适当，方便学生生活和学习。

吉首大学张家界校区位于张家界市永定区，周边交通方便。距市中心仅几分钟路程。校门口公交停靠站有3路、10路、7路车经过，交通便利。