吉林省社会科学院高句丽研究中心成立于2004年8月(吉编办[2004]138号), 为从事全省高句丽问题研究和协调机构。主要职责是：负责制定全省高句丽研究等边疆史地重大问题的规划及重点课题的确定；负责对省内大专院校、科研院所和专家、学者研究高句丽等边疆史地重大问题的组织、协调、联络、服务工作；负责高句丽研究队伍建设规划，开展培训、和交流活动；负责高句丽研究成果的宣传、普及工作；负责编辑出版《东北史地》学术月刊等工作。

吉林省高句丽研究中心由吉林省社会科学院代管，中心主任由有关领导兼任，副主任张福有、邴正，秘书长付百臣，内设办公室、研究室、《东北史地》编辑部。