原理

1998年Maxygen公司的Stemmer等人提出了一种新的分子育种方法——全基因组重排技术，这种技术是分子定向进化在全基因组水平上的延伸，它将重组的对象从单个基因扩展到整个基因组-，因此可以在更为广泛的范围内对菌种的目的性状进行优化组合。进行基因组重排首先需要有一个含有各种不同正突变的基因组库(例如：通过经典的诱变育种得到目的性状发生改进的不同的正突变菌株就构成了所需的基因组库)，随后通过原生质体融合将这些正突变菌株的基因组进行随机重组，并筛选目的性状得到进一步改进的菌株来进行下一轮基因组重排，这样通过循环多轮的随机重组可以快速、高效地选育出表型得到较大改进的杂交菌种。基因组重排技术提出后的短短几年时间，在菌种改进方面已经取得了很突出的成果。