基督教科学会（The Church of Christ, Scientist，常称作Christian Science），亦译为基督教科学派、基督科学教会，总教堂（或称母教堂）位于美国麻萨诸塞州波士顿，由玛丽·贝克·艾迪于1879年创立。此教派的教义主要来自她所著的《科学与健康暨解经之钥》。

位于波士顿的总教堂艾迪宣称，既然上帝是绝对的善与完美，那么罪、疾病和死亡都与上帝无关，因此都不是真实的。这个物质世界是虚幻的，真正的真理和存在都是在精神层面上，所以所有的物质上的“错误”都可以靠更高层次的灵修来解决。她更进一步地说明她所领悟出来的道理正是如同《圣经》里所记载的那样，耶稣基督有治愈能力也是因为有同样的领悟。基督科学教徒（或基督科学者）则根据这个教义深信疾病可以透过信仰，祈祷和领悟更高一层对于上帝、基督与人之间的关系而治愈。这样的结果就是教徒有病痛时往往只靠着祈祷而不寻求医疗协助，他们的教会刊物上也常常刊登这类的透过祈祷而治愈的报导。

基督教科学会非传统的传教方式和内容因此引起许多争议。一些教会人士因为不肯寻求正常的医疗协助，只靠着祈祷来治病，结果死于一些本来可以医好的疾病。其中因此而死的小孩，他们的父母因此被提起刑事诉讼，理由是疏忽和不当致死。教会方面则辩称根据他们的完整记录，他们的“灵修治病”祈祷方式确实治愈了许多连医生都束手无策的绝症。

在神学界，基督教科学会的教义也引起一阵骚动，特别是透过19世纪起盛行的科学角度来看（注：也就是基督科学所称的“科学”完全称不上科学），一些其他基督教派人士则讥讽的说科学会只能算是一种圣经解说学校，只是一时的，根本不算是一种新的基督教派。即便如此，基督教科学会在发展初期，以及在1960和1970年代的再次发展却也因此吸引很多人的注意，也得到了快速的成长。

在分类上，基督教科学会通常被归类到基督教分支的复原教派这一旁支上，不过也引起一些争议。