寒山书院始创于2003年，是寒山寺自办的一所以学修并重的汉语系佛学院。其院训是：“勤学求真，崇善净意。”

书院以培养爱国爱教，遵纪守法，信仰纯正的僧才为目的，鼓励学僧从事佛学研究，或佛教文化交流及寺院的管理。至今已招收六届学员，到2011年为止，共毕业学僧200多名。

寒山书院开办的佛学课程，主要有：弥陀要解、沙弥律约、比丘戒律、佛典选读、二课合解、佛学基础、遗教三经、百法明门论、金刚经、教观纲宗；文化课程：书法、英语、大学语文、古代汉语、信息技术；此外还有特色课程：寒山子研究、印祖文钞等。

寒山书院的院长为明学法师，中国佛教协会副会长、江苏省佛教协会会长、苏州灵岩山寺方丈。